کریم باقری در گفتگو با روزنامه فرهیختگان تایید کرده که کسی از پرسپولیس با او برای تمدید قرارداد تماس نگرفته است: «تا الان که تماسی نگرفته‌اند. اگر تمایلی برای ادامه همکاری نداشته باشند هیچ‌مشکلی وجود ندارد. در هر صورت هر آمدنی رفتنی دارد. قرار نیست که تا ابد در پرسپولیس بمانم.»
روز گذشته برخی منابع به ایران اینترنشنال گفتند که نهادهای امنیتی به مدیران پرسپولیس اعلام کرده‌اند کریم باقری باید از کادر فنی پرسپولیس خارج شود. آنها اجازه تمدید قرارداد با کریم باقری را به دلیل حمایتش از خیزش انقلابی مردم ایران نداده‌اند.
کریم باقری در پاسخ به این سوال که «شاید به باشگاه اعلام کرده‌اند که با شما همکاری نداشته باشند؟» گفته: «این را می‌توانید از باشگاه بپرسید. به‌هر‌حال من قراردادی با باشگاه ندارم و پیشنهادی هم برای عقد قرارداد جدید از سوی باشگاه نداشته‌ام. شاید باشگاه درگیر قراردادهای بازیکنان و افراد دیگر است و فرصت فکر کردن به من را نداشته‌اند.»
او همچنین اضافه کرده که «تا الان که هیچ‌کس به من نگفته اجازه کار ندارم و بحث خستگی هم که مطرح کردید عجیب است. وقتی تا الان با من تماسی از سوی باشگاه گرفته نشده چطور شایعه می‌کنند خسته هستم و می‌خواهم دور از فوتبال باشم؟ همیشه گفته و باز هم می‌گویم اگر باشگاه تمایل به همکاری داشته باشد تماس می‌گیرند و پیشنهادشان را مطرح می‌کنند، اما اگر تماسی گرفته نمی‌شود دلیل ندارد این حواشی ایجاد شود.»
بازیکن پیشین پرسپولیس گفته است: «حق مسلم باشگاه و سرمربی تیم است که در این مورد تصمیم بگیرند. من هیچ‌وقت از هیچ‌کس توقعی نداشته و نخواهم داشت. همان‌طور‌که گفتم اگر خواستند مثل سال‌های گذشته در خدمتم اگر هم نه بدون هیچ‌مشکل و ناراحتی این همکاری ادامه پیدا نمی‌کند.»
او همچنین گفته: «من با هیچ‌کس در باشگاه و تیم مشکلی ندارم و مساله خاصی هم پیش نیامد.»
باقری البته گفته که حتی یحیی گل‌محمدی هم برای لیست ورود و خروج تیم با او مشورت نکرده است: «وقتی قراردادی با باشگاه ندارم و تماسی هم برای همکاری نبوده چرا باید مشورت می‌کردند.»
در روزهای گذشته نهادهای امنیتی اجازه حضور جواد نکونام را هم به عنوان سرمربی استقلال ندادند اما خبرگزاری فارس اعلام کرد کاپیتان پیشین تیم ملی و سرمربی سابق فولاد با «پذیرفتن اشتباهات گذشته» و با «عفو رهبری»، توانسته به میادین فوتبال برگردد.
کریم باقری اما در شروع اعتراضات پس از کشته شدن ژینا (مهسا) امینی در بازداشتگاه گشت ارشاد، در صفحه اینستاگرامش نوشت: «در این روزهای سخت من و امثال من وظیفه داریم کنار مردم باشیم چون از خود مردم هستیم. چه دنیای ورزشی شد، چه تیم ملی‌ای شد، چه می‌گذرد بر ما؟ ... حال این روزهای کشورم و مردمم را حتی اگر در خواب هم می‌دیدم باورم نمی‌شد.»
او همچنین در هفته نخست اعتراضات در حمایت از علی کریمی و خطاب به حسن عباسی نوشت: «علی کریمی نه خائن است نه وطن فروش، بلکه یک میهن‌پرست باشرف است. قابل توجه مردک پاچه‌خوار که می‌خواست کاخ سفید را حسینیه کند. تو با این ادبیات سخیف به هر قشری از جامعه توهین کرده‌ای و می‌کنی. کسی هم نیست جلوی تو را بگیرد و هر روز گستاخ‌تر از دیروز پیش می‌روی. همه ما به‌خاطر رفتن کسانی امثال تو به خیابان‌ها آمدیم. شماها برای این مردم چه کرده‌اید جز حرف بیهوده و توهین به قهرمانان آنان؟»
این واکنشی به اظهارات عباسی، یکی از حامیان تندروی جمهوری اسلامی بود که در یک سخنرانی به فوتبالیست‌ها و خانواده‌هایشان توهین کرده بود.
باقری پس از زلزله خوی، شماره حسابی برای جمع کردن کمک‌های مردمی اعلام کرد اما جمهوری اسلامی به بهانه تجمیع مراکز جمع‌آوری کمک‌ها، حساب او را مسدود کرد.
از سوی دیگر رسانه‌های امنیتی جمهوری اسلامی دو ماه پس از شروع خیزش انقلابی نوشتند: «در پی انتشار مطالبی از سوی یحیی گل‌محمدی، سرمربی و کریم باقری، مربی تیم فوتبال پرسپولیس در فضای مجازی، باشگاه پرسپولیس باقری را ۲۰ درصد و گل‌محمدی را ۱۵ درصد مبالغ قراردادشان جریمه کرده است.»
نهادهای امنیتی سال گذشته از طریق مصطفی آجرلو، از تمدید قرارداد وریا غفوری با استقلال ممانعت کردند. وریا ابتدا به فولاد رفت و در نیم‌فصل از این تیم جدا شد. او در نهایت چند هفته پیش از فوتبال خداحافظی کرد.
برخوردهای امنیتی با فوتبالیست‌هایی که در جریان خیزش انقلابی مردم ایران از معترضان حمایت کردند، به بازداشت فوتبالیست‌هایی مثل حسین ماهینی، وریا غفوری و حامد لک منجر شد.
همچنین به دلیل حمایت بازیکنان پرسپولیس از حسین ماهینی، نیروهای امنیتی در شب بازی با تراکتور در هفته هفتم آخرین لیگ برتر، به اردوی قرمزها یورش بردند تا تعدادی از بازیکنان از جمله سروش رفیعی را بازداشت کنند اما با دخالت اطرافیان و مسوولان تیم، آن‌شب هیچ‌کدام از بازیکنان پرسپولیس بازداشت نشدند.
نهادهای امنیتی همچنین پاسپورت علی دایی را به دلیل حمایت از خیزش انقلابی و اطلاع‌رسانی درباره کشته شدن یک دانش‌آموز معترض در اردبیل گرفتند و اسطوره فوتبال ایران و خانواده‌اش را ممنوع‌الخروج کردند. حتی هواپیمای حامل همسر و دختر علی دایی از آسمان دوبی به کیش برگشت تا آنها از ایران خارج نشوند.
